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益生菌、胃肠道微生物和宿主之间相互作用的研究进展

日期: 2017-02-25
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导读


  益生菌是乳制品和功能性食品工业的重要部分,带了多次十亿美元的市场。益生菌的多边作用包括预防感染,降腹泻发病率,抗微生物活性,病原菌的竞争性排斥,免疫耐受,调减大肠癌生物标志物,达到皮屏障功能,增加细胞免疫力,增加体液反应,降血胆固醇水平,调减过敏肠道疾病症状等。目前研究的多数益生菌来自乳杆菌属和双歧杆菌属。乳酸杆菌与发酵产品相关,尤其在奶制品中使用最多。近来向食品吃添加双歧杆菌的研究不断增多,多作为有益添加剂。大部分菌种天然存在于胃肠道,立即多少生物通常能够抗酸、忍胆汁。少数菌株还有发酵果糖诸如人类不能消化的低聚果糖(FOS)和一半子甘露寡糖(GOS)的能力,这些果糖能吧胃肠道内的部分共生菌和益生菌提供一定生长优势。


  胃肠道是一个约有500 种、100 万亿微生物的复杂器官,大概是人类体内细胞总数的10 多倍。对于这些细菌的遗传组成成分,可以在胃肠道中翻译编码成拥有大量生理机能的基因储存器,针对身体宿主的胃肠道产生好作用。胃肠道已经演变成也一个营养和微生物丰富的活部位,细菌在其中不断地旺盛生长。组学技术诸如转录组技术、大基因组学和代谢组学的使用,推动人们了解胃肠道中益生菌如何生长和共生菌如何发挥作用。此外,这些技术促进了解益生菌和共生菌之间以及宿主胃肠道相互之间的联系。在这个之前,根据实验技术的限制,细菌纯培养艺术选择的限制导致对胃肠道内菌种鉴定不充分。近来,16SrRNA 基因测序的广泛使用,大量的新品种得到鉴定并规定胃肠道中大量的细菌属于拟杆菌门(Bacteroides)和厚壁菌门门类(Firmicutes phyla)。


  华盛顿大学Jeffrey Gordon 组的研究表明,因为低脂肪或低碳水化合物饮食的比较瘦人群,那个脂肪减少的同时伴有厚壁菌与拟杆菌数量的比下降。尤其研究发现,即使当相同物种的哺乳动物存在巨大的地理距离时,同物种内的肠道微生物依然较不同物种中进一步相似。这些研究表明,宿主和微生物群明确是共同进步的,还肠道菌群对人类健康具有重要贡献。


  胃肠道中宿主微生物相互作用的超级位置在粘膜中。粘膜中的细菌维持肠道动态平衡,调控免疫系统并要之处免受病原体入侵的超级状态。例如,本来肠道菌群通过竞争排斥竞争抗菌物质的营养、受体结合位点以及产物,来帮助宿主阻止病原菌的侵略。通过受体和不同种类的免疫细胞,胃肠道内免疫系统不绝感应管腔内环境。只层肠上皮细胞将肠腔从原来层区分开。胃肠道内肠道菌群和肠道间存在微妙的意图平衡,立即同平衡区分共生肠道菌群和侵犯病原菌。从胃肠道周围抽取样本,其中重要细胞是肠道上皮细胞(IECs)、M细胞、巨噬细胞和培养突状细胞(DCs)。肠道上皮细胞除了运送可溶性抗原,还显示模式识别受体,例如Toll 种受体(TLRs) 和带有核苷酸结合寡聚样((NOD)-like)受体(NLRs)。M 细胞是缺少微绒毛的上皮细胞,位于细胞的基部,那个作用是向B 细胞、T 细胞及巨噬细胞运输抗原。取样管腔内容物显示,培养突状细胞延伸其树突穿过肠道上皮细胞层,却没破坏肠道上皮细胞间的紧密连接。多免疫细胞表面的Toll 种受体(TLRs)依靠不同免疫刺激而反应不同,因为这提供免疫系统辨别肠道微生物和病菌。例如Toll 种受体2(TLR2)可以识别革兰氏阳性菌细胞壁成分而油磷壁和肽多糖,如果Toll 种受体4(TLR4)可以识别主要来源革兰氏阴性菌的脂多糖。肠道菌群Toll 种受体(TLRs)活性对肠道平衡和肠道受损保护也是必要的。被确定为胃肠道和肠道菌群相互作用调节者的其他一模式识别受体是可溶解的细胞质NLRs,被证明是针对Toll 种受体(TLRs)的增补和协调。这些受体的激活包括NF-κB(κ 基因组合核因子)和MAPK(发生丝分裂原活化蛋白激酶)级联诱导导致重要免疫因子的激发,这些免疫因子包括炎症趋化因子、细胞因子和激励分子。使用各生物部位信息了解肠道菌群。胃肠道益生菌作用涉及多学科研究领域,通过这些研究,逐渐认识宿主和肠道菌群在肠道的相互作用。


  1胃肠道内益生菌的意图


  啊保持完整肠道屏障以保证肠道健康,必须保持肠道动态平衡。屏障受损能致许多肠道疾病包括病原菌感染、肠易激综合症(IBS)和限制罗恩生病(Crohn’s disease)。被损伤的肠屏障伴随紧密连接下降与细胞凋亡增加,立即是肠道克罗恩生病的一个例。此外,缺乏免疫的肠屏障能致粘膜免疫细胞对诸如来源于肠道菌群的无腔内容物的暴露,随即导致不正常免疫反应。动态平衡被认为是由于上皮细胞,特别是粘膜树突状细胞维持。但是益生菌和肠道菌群在肠屏障功能和完整性方面为从到重要的调节作用。


  严密连接就是在邻近上皮细胞间形成相对不通透屏障蛋白质复合物。跨皮电阻测量(TER)凡是用于检测上皮细胞紧密连接的屏障完整性的常用方法。使用增加体外细胞株跨上皮电阻测量,检测益生菌对紧密连接有积极作用。肠道上皮细胞品系感染致病性埃巴氏菌属,导致跨上皮电阻测量下降,达到皮通透性提高和生理功能障碍。


  肠道上皮细胞较早暴露给来活性的喜欢酸乳杆菌而不是热灭活嗜酸乳杆菌, 克了大肠杆菌的不利影响。通过跨上皮电阻测量发现,喜爱酸菌制剂能抽大肠杆菌诱导的紧密连接蛋白质的磷酸化作用。益生菌对屏障功能的其他积极影响表现在:阻碍上皮细胞病原体入侵,发生防御分子,炎性细胞因子的衰减和细胞因子诱导细胞凋亡的防范。这些研究表明无论病原菌是否存在,益生菌对屏障完整性都发生积极的意图。针对大肠炎和败血症的动物模型研究表明,肠道上皮细胞屏障功能增加归因于益生菌活性。体内试验和转录能够更加说明益生菌增加屏障完整性的体制。


  由于树突状细胞在胃肠道粘液的细胞免疫中从重要作用,所以由益生菌调制的培养突状细胞是一个要的研究领域。目前已证明益生菌能够为菌株特有方式诱导树突状细胞而调控T 细胞,标志其在粘膜表面的重要作用。立即同属性被用于通过由嗜酸乳杆菌表达的保护性抗原靶向作用树突状细胞,来维护小鼠免受炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis)的沉重侵害。近来调查显示,益生菌作为胃肠道粘膜预防和保护分子的运输工具具有潜在细胞免疫功效。


  细菌素是有热稳定性的、由于许多乳酸菌产生的抗微生物小肽。通过去除细菌素产物的唾沫乳杆菌(L. alivarius)衍生物,标志唾液乳杆菌保护小鼠免受李斯特菌(L. monocytogenes)染的能力为细菌素的结果。体外抵御病原体的抗微生物活性的方法还包括过氧化氢、乳酸、竞争排斥和免疫系统调控。虽然对病原体的抗微生物活性的这些体内论证仍需要证实,但是由于体外研究和文献得生,体内益生菌能发挥抗菌作用已有有力的证据。因为抗生素可能对肠道微生物群有害,所以能是一个令人兴奋的研究领域。


  细菌存活于肠道中,部分由是那个能够影响宿主对出现的微生物竞争者的鉴别能力,和对传感环境内其它成分和信号的分析能力,立即将有益宿主协调营养需求。


  细菌演变有不同的意图方式。双组分调控体系(2CR)有允许益生菌感应周围环境的效用,连可启动适当转录反应。这些系统由组氨酸蛋白激酶(HPK)和反应调节器(RR)结合。该HPK 收到一个信号,传递给反应调节器, 下一场通过该DNA 结合结构域,启示一个转录反应。其中2 单系统功能特点就在嗜酸乳杆菌中取得确认——胆汁耐受和酸抵抗的意图。上述两者是体现益生菌功能的关键点,连对那是否存活于胃肠道有直接影响。此外,细菌素产量为种群密度依赖方式得到控制。小鼠胃肠道转录研究证实,来植物乳杆菌细菌素操纵子的细菌素免疫蛋白在2单相互独立试验中被诱导,说明了植物乳杆菌这同基因在体内表达情况。缺乏细菌素生产能力的体内益生乳酸杆菌,如果植物乳杆菌和喜欢酸乳杆菌,是不是会引起不同宿主反应,好人非常感兴趣。


  受到关注的细胞对细胞作用的其他一方是群体感应分子AI-2 的发生。立即同信号分子由luxS基因编码,连在革兰氏阳性和阴性菌中出现。在罗伊乳杆菌(L. reuteri)、植物乳杆菌和喜欢酸乳杆菌中,针对luxS 基因作用均发生研究。因为罗伊乳杆菌为例,luxS 基因突变株表明在对数生长过程中ATP合成减少,在小鼠胃肠道内一定生态位适应力下降且生物膜较对照组有所增加厚。Lebeer 相当为证明luxS 突变株对生物膜结构的影响归因于代谢缺陷。其他研究吗证明luxS 突变株在胃液中存活率降低,在小鼠胃肠道中保留时间缩短。这些研究表明,AI-2 信号的生态学及一定生态位的重要和它对胃肠道益生菌作用的逃逸在贡献。AI-2的产量对宿主上皮基因表达可能发生一个信号影响,例如粘蛋白产量或者免疫调制信号。多益生菌微生物内的传播系统可能提高其栖息多种生态位和同各种寄居在胃肠道内菌种的竞争能力。


  2使用转录洞察胃肠道内微生物的意图


  2.1 胃肠道中益生菌的转录反应


  基因退化导致生物合成能力下降的真情证明许多益生菌能够适应胃肠道的进步。此外,这些益生菌编码着重要特征,如果这些特色同时保证其在在恶劣的胃肠道环境受到,例如酸和胆汁抵抗,细胞表面存在蛋白质,可以干扰肠道粘膜和复杂碳水化合物代谢。例如肠道乳杆菌编码复合转运蛋白促进直接源于胃肠道养分的甘甜和氨基酸吸收。Yuan 近来通过比较兔子肠道模型中体内与体外菌株生长蛋白质组学概况来研究宿主在长双歧杆菌NCC2705蛋白质组中诱导的变化。在体内长双歧杆菌中,蛋白质诸如EF-Tu粘附样因子,种盐水解酶和应激蛋白水平上调。有趣的是,和体外条件比,LuxS/AI-2在体内也被诱导。罗伊乳杆菌、植物乳杆菌和约氏乳杆菌在小鼠胃肠道中的基因表达已有研究。


  由于Walter 相当用体内表达技术(in vivo expressiontechnology,IVET)早期只鉴定了3 株在小鼠胃肠道表达的罗伊乳杆菌基因,分别为木糖异构酶、蛋氨酸亚枫还原酶和编码未知功能的蛋白质基因。使用改进的体内表达技术进行继续研究,评议了小鼠胃肠道植物乳杆菌72 种基因表达。这些基因涉及碳水化合物和氨基酸代谢,应激性以及潜在的宿主相互作用的细胞外因素。


  Denou 相当通过基因表达研究发现,在小鼠的胃、盲肠、空肠和结肠表达了不同的大概氏乳杆菌基因簇,立即同现象说明不同基因表达概况依赖于转录位置, 如果在胃、盲肠、空肠和结肠中分别有786、391、296 和26单基因转录。该小组还研究了大约氏乳杆菌在肠中停留5 d 和12 d 继的基因表达,因为鉴定和肠持久性表型相关的基因。和肠持久性表型相关的3 单基因座包括胞外多糖(EPS)的生物合成,同磷酸甘露糖磷酸系统(PTS)和可能的蛋白酶。突变株中蛋白酶和同磷酸甘露糖磷酸系统(PTS)的缺乏降低了大约氏乳杆菌在肠道停留时间,暗示这些基因座对肠道持久性起一定作用。此外eps 基因座缺失导致肠持久性略有提高。


  研究分析了植物乳杆菌在无菌小鼠盲肠的基因表达图谱,向小鼠饲喂标准低脂肪或高脂肪的西式日粮,因为探索日粮对胃肠道益生菌基因表达的影响。没有脂肪日粮含复合植物多糖高,如果西式日粮含单糖和脂肪高。募集食标准日粮的小鼠,那个定植水平要高出10 倍,立即是因为碳水化合物代谢和细胞表层功能细菌基因表达不同。研究人员认为,植物乳杆菌修改了它的基因表达,调减了细胞表面的LTA 水平。这个为手段限制对宿主免疫系统成分的暴露。此外,研究人员观察到小鼠胃肠道内为诱导的18%的植物乳杆菌与其他肠乳酸杆菌有同源性,如果不和其他乳酸菌存在同源性。多基因和细胞表层未知功能或启动细胞表层未知功能相关。立即同结果反映了测序菌株间较基因组分析的有用。因为该技术强调食物适应乳杆菌如保加利亚乳杆菌和瑞士乳杆菌与肠道适应乳杆菌如嗜酸乳杆菌和植物乳杆菌间的差别。由于酸奶发酵剂已经历了基因组衰变,如果保加利亚乳杆菌能够适应营养丰富的幼稚环境,如果用于转运和代谢途径的被编码的益生乳杆菌, 可以促进其利用胃肠道多种碳水化合物来适应胃肠道环境。比好酸乳杆菌和干酪发酵剂瑞士乳杆菌的基因组,它有紧密相关性并享受75%共同基因。虽然它们有相似性,但是在基因集合上明显不同,立即证明其能够适应不同的环境。例如,喜爱酸乳杆菌利用复杂的碳水化合物,如果棉子糖和寡糖编码粘液结合蛋白和转运蛋白——立即是益生菌的效用和其适应胃肠道环境这少只重要特征。相反,瑞士乳杆菌缺乏这些基因集合,如果编码用于脂肪酸合成和一定氨基酸代谢的其他基因。动物模型和身体系统的其他菌株测序以及胃肠道转录分析使人们尤其了解胃肠道内益生菌和共生菌功能。


  2.2 胃肠道中微生物和益生菌相互作用


  使用基因组序列和进步基因芯片技术,造福研究更生长双歧杆菌NCC2705和人类微生物区系的重要成份以及多形拟杆菌在小鼠胃肠道内哪对彼此存在作出反应。试验中构建一个包含有寡核苷酸基因芯片技术,该寡核苷酸类来自单芯片上每个基因组。该研究分别被小鼠饲喂单一菌株和共同菌株。针对无菌小鼠饲喂联合菌株,但是取得多糖类物质,降解基因的扩增。即使多形拟杆菌而言,发挥的上调基因和碳水化合物运输和代谢,能产生,糖苷水解酶和多糖裂解酶相关。这些结果表明,在长双歧杆菌存在下由多形拟杆菌靶向定位的代谢多糖增加。


  在长双歧杆菌存在条件下,来淀粉利用系统的1/3基因和族体在多形拟杆菌基因组中差异表达。近来发生研究表明,由于拟杆菌门淀粉利用系统(starch utilization system)使用胃肠道复杂聚糖类物质,提供了每日摄入热量的10%。草杆菌门对原本不可消化的碳水化合物的发酵能力,标志了这些肠道细菌的重要性能。对比,共同定植后的增长双歧杆菌较少改变表达基因,和多形拟杆菌相比,分别为3.5%针对14.2%。尤其分析揭示,在长双歧杆菌存在条件下和多形拟杆菌木糖苷降解和木糖分解代谢相关的基因上调以及同个别菌株甘露糖降解有关的基因差异表达,尤其在共同定植过程中,多形拟杆菌和增长双歧杆菌分别对甘露糖苷酶基因增量调节和减量调节。这些结果表明在长双歧杆菌存在时多形起杆菌可以锁定胃肠道中格外多糖来源。此外,多形拟杆菌与干酪乳杆菌或动物双歧杆菌联合定植转录反应不如长双歧杆菌引起的明显。动物双歧杆菌可以启迪与转录和复制相关的大多形拟杆菌基因,如果干酪乳杆菌则诱导用于碳水化合物运输代谢和无机离子运输代谢的基因。由于3 株菌株引发了在档次和类型上还存在差异的大多形拟杆菌不同转录反应,该研究揭示肠道细菌之间发生的重要本质关系。


  2.3 胃肠道对益生菌的转录反应


  胃肠道内益生菌作用的适当机制并不完全知道,那个相互作用是多地方的。通过宿主转录反应分析,一定免疫细胞以及免疫因子应答研究揭示了多细胞类型和效用分子和细胞受体和细胞信号分子的介入情况。此外,不同的种类和品系表现有细胞信号起始的多样化和距离程度, 立即回又造成健康或疾病的不同结果。根据以上讨论的研究,Sonnenburg 相当(2006)连过调查同一只小鼠肠道上皮水平的宿主反应, 啊证明了宿主对多形拟杆菌和增长双歧杆菌联合定植反应。单纯菌株定植和共同菌株定植宿主反应是不同的。分析表明,宿主对多形拟杆菌反应集中在TNF-α、T细胞及巨噬细胞,但是宿主对增长双歧杆菌的反应集中在IFN-γ。在共同定植试验中,天然免疫的少只菌株基因协同诱导。鼠胃肠道中由于长双歧杆菌诱导的其他一反应是下调抗菌蛋白的能力。Reg3γ(再生胰岛衍生蛋白3γ)被多形拟杆菌上调。


  研究人员分析了益生菌在正常人体十二指肠中基因的转录。在一个随机双盲安慰剂对照交叉研究中, 针对健康受试者给予益生植物乳杆菌WCFS1。结果确定了在粘膜表面和细胞途径内和免疫耐受相关的基因表达模式。从十二指肠取样对对数生长细胞、以不变应万变细胞或很细胞处理6 h继用于分析。3种极都造成免疫应答相关基因的启发。对数生长期细胞(logrimithic phasecells)和一定期细胞(stationary phase cells)的启发类型存在差异。固定期细胞诱导与免疫耐受建立相关基因,例如NFκB(κ 基因组合核因子)和转录因子JUN,如果对数生长期细胞诱导针对代谢功能反应。此外,多细胞过程的基因表达也存在差异,包括免疫调制、细胞凋亡、细胞对细胞信号、细胞循环和细胞粘附。依照讨论结果,支持了胃肠道益生菌的意图,连显示其潜能。人人还希望着人类和动物模型胃肠道中基因表达的其他研究结果。


  3前途展望


  尽管胃肠道和肠道菌群间相互作用仍不完全知道,但是胃肠道内益生菌间的相互作用是伟大且多地方的。其他方面,如果益生元和益生菌向胃肠道投放以及相作用类型需要考虑。这些标准可能会增加或减少益生菌产生的有利效应。


  近来对大肠癌小鼠模型的一个研究表明:配方酸乳粉包埋的喜欢酸乳杆菌比单独使用益生菌的积极作用会增强。其他研究还参加基体效应的影响,如果乳基对益生菌基因表达的影响。啊保持胃肠道中益生菌健康属性,所进入的最优条件是非常重要的。


  自然,使用遗传手段促进了人人对胃肠道中菌群复杂性的询问。我们掌握了肠道菌群的意图,并且遗传手段于不断改进,例如构造缺乏一个或者多只蛋白质菌株,如果我们能够通过分析特定蛋白质,因为确定其在益生功能中的作用。例如对基因失活或缺少的喜欢酸乳杆菌,使用遗传技术证实了重要益生菌的特征,如果细胞表面因子,包括S层蛋白,胆汁耐受,酸性压力,FOS的起色和代谢,LuxS/AI-2,细菌素运输和草酸盐降解。这些特色对益生菌在人类健康中的作用有重要的贡献。例如为研究在正常肠道的平衡条件和感染大肠炎等疾病条件下上述特征的重要,体内研究是非常重要的。上述讨论中,在病原体抑制,屏障功能维持和免疫系统调节中益生微生物的潜能都取得了证实。由于益生菌株能够产生抗菌化合物,导致表层因素的存在或缺少,所以诱导粘膜表面亲炎或抗炎反应能力或发酵胃肠道复合多糖的能力,还不同的益生菌株会带不同的正常益处,所以需要举行进一步的体内研究,尤其是因为身为受试者,测定菌株,剂量和胃肠道益生菌的一定位点健康效应。


来:华夏食品学报

 

 

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